Идентификация вариации числа копий CAPN10 у тайцев с диабетом 2 типа с помощью мультиплексной ПЦР и денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии ( DHPLC ).
Было показано, что вариации числа копий (CNV) связаны с несколькими заболеваниями. Они могут вызывать отклонение генотипов от равновесия Харди-Вайнберга (HWE) . Исследования ассоциации генетический случай-контроль в Тайланде показали, что распределение генотипов CAPN10 Indel19 отклонялось от HWE после исправления ошибки генотипирования. Таким образом, мы стремимся идентифицировать CNV в области CAPN10 Indel19.
Метод полуколичественной денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии (DHPLC) был использован для обнаружения CNV в области маркера CAPN10 Indel19 в когорте 305 пациентов с диабетом 2 типа и 250 контрольных субъектов без диабета. CNVs в области CAPN10 Indel19 был успешно обнаружен с помощью DHPLC .
После корректировки определения генотипа на основе статуса идентифицированных CNV, генотипы CAPN10 Indel19 были хорошо приспособлены для HWE (p> 0,05) . Однако мы не обнаружили связи между генотипами CNV и риском диабета 2 типа в нашей популяции. CNV в CAPN10 были идентифицированы у тайцев. Эти CNVs приводят к отклонению от HWE генотипов CAPN10 Indel19 . После исключения идентифицированных CNV из анализа, CAPN10 Indel19 был связан с диабетом 2 типа. Информация, полученная в результате нашего исследования, может быть полезна для точности генотипирования SNP, находящихся в области CNV .
Нуклеаза DHPLC / SURVEYOR: чувствительный, быстрый и доступный метод анализа мутаций BRCA1 и BRCA2 в семьях рака груди.
Наследственный рак молочной железы составляет около 10% всех случаев рака молочной железы, и гены BRCA1 и BRCA2 были идентифицированы как проверенные гены предрасположенности к этой патологии. Тестирование на мутации гена BRCA обычно основано на подходе предварительного скрининга, таком как метод частичной денатурации DHPLC и прямое капиллярное секвенирование.
Однако этот подход требует много времени из-за большого размера генов BRCA1 и BRCA2. Недавно был разработан новый недорогой и экономящий время протокол DHPLC для анализа генных мутаций с использованием расщепления нуклеазой SURVEYOR® и анализа DHPLC . Подгруппа из 90 пациентов, включенных в Программу генетического консультирования Национального онкологического центра Бари (Италия), была проведена для проверки этого подхода.
Предыдущий ретроспективный анализ показал, что 9/90 пациентов (10%) были мутированы в генах BRCA1 и BRCA2, и эти данные были подтверждены настоящим подходом. Образцы ДНК были подвергнуты Landing PCR и, впоследствии, расщеплению нуклеазой SURVEYOR (®). Ампликоны BRCA1 и BRCA2 были разделены на группы в зависимости от размера ампликона, чтобы обеспечить переваривание нескольких ампликонов.
Продукт этой реакции анализировали на системе анализа высокочувствительных фрагментов трансгеномной нуклеиновой кислоты WAVE . Оператор, выполнявший метод обследования DHPLC, в то время не знал результатов секвенирования. СЮРВЕЙЕРСКИЙ (®) нуклеаза DHPLC подход был способен обнаружить все изменения с чувствительностью 95%. Кроме того, чтобы сэкономить время и реагенты, был утвержден препарат для настройки мультиампликона.
confocal-club
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates or other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates or other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from serum, plasma, tissue homogenates or other biological fluids.
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from serum, plasma, tissue homogenates or other biological fluids.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Human Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Human Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Human Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Mouse Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Mouse Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Mouse Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Porcine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Porcine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Porcine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Goat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Goat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Goat Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rabbit Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rabbit Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Rabbit Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Canine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Canine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Canine Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Monkey Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Monkey Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Monkey Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Recombinant Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1)
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Bovine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Bovine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Bovine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Canine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Canine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Description: Quantitative sandwich ELISA for measuring Canine Myosin-1 (MYH1) in samples from cell culture supernatants, serum, whole blood, plasma and other biological fluids.
Myosin heavy polypeptide 1 (MYH1) polyclonal antibody
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Guinea pig Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Guinea pig Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Description: A competitive ELISA for quantitative measurement of Guinea pig Myosin 1(MYH1) in samples from blood, plasma, serum, cell culture supernatant and other biological fluids. This is a high quality ELISA kit developped for optimal performance with samples from the particular species.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) Protein
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates and other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates and other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates and other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates and other biological fluids.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: Enzyme-linked immunosorbent assay based on the Double-antibody Sandwich method for detection of Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from Serum, plasma, tissue homogenates, cell lysates, cell culture supernates and other biological fluids with no significant corss-reactivity with analogues from other species.
Human Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) ELISA Kit
Description: _x000D_ MYL5 Human Recombinant produced in E.Coli is a single, non-glycosylated polypeptide chain containing 197 amino acids (1-173 a.a.) and having a molecular mass of 22.1kDa.;MYL5 is fused to a 24 amino acid His-tag at N-terminus & purified by proprietary chromatographic techniques.
Description: A sandwich ELISA kit for detection of Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult from Human in samples from blood, serum, plasma, cell culture fluid and other biological fluids.
ELISA kit for Human MYH1 (Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult)
Description: A sandwich ELISA kit for quantitative measurement of Human MYH1 (Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult) in samples from Serum, Plasma, Cell supernatant
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.
Description: Enzyme-linked immunosorbent assay based on the Double-antibody Sandwich method for detection of Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1) in samples from Serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids with no significant corss-reactivity with analogues from other species.
Description: A Rabbit polyclonal antibody against Mouse Myosin Heavy Chain 1, Skeletal Muscle, Adult (MYH1)
×
Высокоэффективная жидкостная хроматография в частично денатурирующих условиях ( dHPLC ) – это быстрый и экономичный метод скрининга молекулярных дефектов: четыре новые мутации, обнаруженные при Х-сцепленной хронической гранулематозной болезни.
Внедрение точных методов в рутинной диагностике хронической гранулематозной болезни (ХГБ), которые ускоряют скрининг молекулярных дефектов, может иметь решающее значение для быстрого предположения прогноза пациента. В этом исследовании сравнивалась эффективность анализа однонитевого конформационного полиморфизма (SSCP) и высокоэффективной жидкостной хроматографии в частично денатурирующих условиях (dHPLC) для скрининга мутаций у пациентов с CGD. Мы отобрали 10 пациентов мужского пола с ХГБ, в анамнезе которых были тяжелые рецидивирующие инфекции и нарушение функции респираторного взрыва. Образцы гДНК, мРНК и кДНК получали стандартными методами. Экзоны CYBB амплифицировали с помощью ПЦР и проверяли с помощью SSCP или dHPLC. Аномальные фрагменты ДНК секвенировали, чтобы выявить природу мутаций.
Методы SSCP и dHPLC показали аномалии ДНК соответственно в 55% и 100% случаев. Секвенирование образцов аномальной ДНК подтвердило мутации во всех случаях. Были идентифицированы четыре новые мутации в CYBB, которые были обнаружены только при скрининге dHPLC (c.904 insC, c.141 + 5 g> t, c.553 T> C и c.665 A> T) . Эта работа подчеркивает актуальность dHPLC, чувствительного, быстрого, надежного и экономичного метода скрининга мутаций при CGD, который в сочетании с функциональными анализами, оценивающими респираторный взрыв фагоцитов, будет способствовать ускорению окончательной диагностики X-сцепленного CGD, непосредственно лечение, генетическое консультирование и четкое предположение о прогнозе. Эта стратегия особенно подходит для развивающихся стран.
Использование DHPLC (денатурирующая высокоэффективная жидкостная хроматография) при скрининге II уровня гена CFTR в пренатальной диагностике.
ЦЕЛЬ
Цель исследования – оценить роль денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии (DHPLC) во втором уровне скрининга гена регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR).
МЕТОДЫ
9-месячное проспективное исследование, проведенное в период с июня 2008 г. по март 2009 г. в Медицинском центре Artemisia Fetal Medical Heart, включало 3829 образцов околоплодных вод у женщин, перенесших амниоцентез в середине триместра. Генетический диагноз CF был основан на исследовании основных мутаций CFTR. ген на ДНК плода, выделенный из амниоцитов (скрининг первого уровня) с использованием различных коммерческих диагностических систем. Скрининг второго уровня с использованием DHPLC на амниотической жидкости и образце крови пары был предложен в случае гетерозиготных на первом уровне плода.
ПОЛУЧЕННЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ
Из 3829 плодов 134 оказались положительными, 129 – гетерозиготными и 5 – пораженными . Из 129 пар после соответствующего генетического консультирования 53 запросили скрининг второго уровня. При использовании DHPLC 44 пары оказались отрицательными, а в девяти парах были идентифицированы девять редких мутаций.
ВЫВОДЫ
Скрининг первого уровня может быть полезен для выявления до 75% мутаций МВ . Скрининг второго уровня позволяет выявить еще 10% мутантных аллелей. Было обнаружено, что DHPLC является надежным и специфическим методом быстрой идентификации редких мутаций CFTR, которые не были обнаружены при первоначальном скрининге первого уровня.
Эффективность dHPLC для полуавтоматического анализа кДНК-AFLP и сбора фрагментов в модели гена устойчивости к парше яблони.
Анализ кДНК-AFLP для профилирования транскриптов был успешно применен для изучения многих биологических систем растений, особенно взаимодействий между растениями и микробами. Однако, как сообщается , разделение фрагментов кДНК-AFLP с помощью гель-электрофореза является трудоемким с ограниченным потенциалом автоматизации, а сбор дифференциальных полос для идентификации генов является еще более трудоемким.
В этой работе мы представляем использование dHPLC (денатурирующая высокоэффективная жидкостная хроматография) и автоматизированный сбор фрагментов ДНК с использованием системы WAVE (®) для анализа и восстановления фрагментов кДНК-AFLP .
Этот метод успешно применяется к взаимодействию Malus-Venturia inaequalis , что позволяет собрать 66 различных фрагментов, полученных из транскриптов для генов яблока, предположительно участвующих в защитной реакции, активируемой геном устойчивости к HcrVf2.
Результаты, подтвержденные количественной ОТ-ПЦР в реальном времени, согласуются с исследуемым взаимодействием растения и патогена, и это дополнительно подтверждает пригодность dHPLC для профилирования транскриптов кДНК-AFLP . Обсуждаются особенности и преимущества этого нового подхода, демонстрирующие, что это почти полностью автоматизируемое и экономичное решение для обработки большого количества образцов и сбора дифференциальных генов, участвующих в других биологических процессах и немодельных растений.
