Применение DHPLC- скрининга гена TGFBR-3 у китаянок


confocal-club

Генотипирование фактора ингибирования миграции макрофагов (MIF) Полиморфизм повторов CATT₅₋₈ с помощью денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии ( DHPLC )

Фактор ингибирования миграции макрофагов (MIF) представляет собой провоспалительный цитокин, экспрессирующийся во многих различных типах клеток и участвующий в патогенезе множества острых и хронических воспалительных заболеваний. Переменное количество тандемных повторов (VNTR) CATT5-Eight в положении -794 в промоторе гена MIF было связано с несколькими патологическими состояниями человека. Описаны различные методы генотипирования тетрануклеотидных повторов CATT.

Здесь мы впервые сообщаем о полной характеристике полиморфизма повторов CATT5-Eight с использованием исключительно метода денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии (DHPLC) в частично денатурирующих условиях.

Этот подход, основанный на пошаговом протоколе DHPLC, позволил точно определить все гомозиготные и гетерозиготные генотипы в 350 образцах ДНК от контрольных субъектов. Результаты были подтверждены сравнением с секвенированием ДНК, и подход DHPLC был точным, чувствительным и хорошо воспроизводимым.

Данные текущего исследования демонстрируют, что этот метод анализа с помощью DHPLC может представлять собой мощный и чувствительный альтернативный инструмент для быстрого и эффективного генотипирования коротких тандемных повторов, представляющих ограниченное количество аллелей.

DHPLC  — это высокочувствительный и быстрый метод скрининга для выявления мутации BRAF (V600E) при папиллярной карциноме щитовидной железы.

Сообщалось, что мутация BRAF (V600E) встречается в 30–80% папиллярных карцином щитовидной железы (PTC). Хотя прямое секвенирование — это метод, наиболее часто используемый для выявления мутаций, этот метод недостаточно чувствителен для точного обнаружения мутаций низкого уровня. Чтобы определить оптимальный диагностический метод для выявления мутации BRAF (V600E) в PTC , мы сравнили диагностическую эффективность четырех репрезентативных методов обнаружения в фиксированных формалином парафиновых тканях щитовидной железы, полученных от 40 пациентов с диагнозом PTC. Чтобы обнаружить мутацию BRAF (V600E), мы амплифицировали экзон 15 гена BRAF и провели мутационный анализ с прямым секвенированием, денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографией (DHPLC), пиросеквенированием и колориметрическим анализом.

Мутация BRAF была обнаружена в 33 случаях (82,5%) с помощью DHPLC, в 23 случаях (57,5%) с помощью прямого секвенирования, в 22 случаях (55,0%) с помощью пиросеквенирования и в 37 случаях (92,5%) с помощью колориметрического анализа. Чувствительность, отрицательная прогностическая ценность и точность DHPLC были 100%. Специфичность и положительные прогностические значения для DHPLC, прямого секвенирования и пиросеквенирования составили 100%, а для колориметрического анализа — 14,3% и 83,8% соответственно. Значение каппа для DHPLC было идеально 1,0, что превосходило другие методы. В заключение, DHPLC — это чувствительный, специфический и точный метод обнаружения мутации BRAF (V600E), особенно мутации низкого уровня, в PTC.

confocal-club
confocal-club

Recombinant Human Glutaminase kidney isoform, GST, E.coli-10ug

QP6095-ec-10ug 10ug
EUR 326.4

Recombinant Human Glutaminase kidney isoform, GST, E.coli-1mg

QP6095-ec-1mg 1mg
EUR 2763.6

Recombinant Human Glutaminase kidney isoform, GST, E.coli-200ug

QP6095-ec-200ug 200ug
EUR 1077.6

Recombinant Human Glutaminase kidney isoform, GST, E.coli-500ug

QP6095-ec-500ug 500ug
EUR 1816.8

Recombinant Human Glutaminase kidney isoform, GST, E.coli-50ug

QP6095-ec-50ug 50ug
EUR 434.4

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody

20-abx126919
  • EUR 493.20
  • EUR 710.40
  • 100 ul
  • 200 ul

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody

abx032915-400ul 400 ul
EUR 627.6

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody

abx032915-80l 80 µl
EUR 343.2

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody

20-abx311936
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Human Glutaminase liver isoform, mitochondrial (GLS2)

1-CSB-EP887058HU
  • EUR 606.00
  • EUR 318.00
  • EUR 2192.40
  • EUR 919.20
  • EUR 1461.60
  • EUR 402.00
  • 100ug
  • 10ug
  • 1MG
  • 200ug
  • 500ug
  • 50ug
Description: Recombinant Human Glutaminase liver isoform, mitochondrial(GLS2) expressed in E.coli

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody (HRP)

20-abx311937
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody (FITC)

20-abx311938
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Glutaminase Liver Isoform, Mitochondrial (GLS2) Antibody (Biotin)

20-abx311939
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Gls2 ELISA Kit| Rat Glutaminase liver isoform, mitochondrial EL

EF018742 96 Tests
EUR 826.8

Human Glutaminase liver isoform, mitochondrial (GLS2) ELISA Kit

abx392226-96tests 96 tests
EUR 1093.2

Gls2 ELISA Kit| Mouse Glutaminase liver isoform, mitochondrial

EF015050 96 Tests
EUR 826.8

Mouse Glutaminase liver isoform, mitochondrial, Gls2 ELISA KIT

ELI-27365m 96 Tests
EUR 1038

Human Glutaminase liver isoform, mitochondrial, GLS2 ELISA KIT

ELI-20970h 96 Tests
EUR 988.8

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-100ug

QP8210-ec-100ug 100ug
EUR 685.2

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-10ug

QP8210-ec-10ug 10ug
EUR 326.4

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-1mg

QP8210-ec-1mg 1mg
EUR 2763.6

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-200ug

QP8210-ec-200ug 200ug
EUR 1077.6

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-500ug

QP8210-ec-500ug 500ug
EUR 1816.8

Recombinant Human Glutaminase liver isoform, His-SUMO, E.coli-50ug

QP8210-ec-50ug 50ug
EUR 434.4

Recombinant Glutaminase (GLS)

4-RPJ026Hu01
  • EUR 528.58
  • EUR 265.20
  • EUR 1652.16
  • EUR 630.72
  • EUR 1141.44
  • EUR 429.60
  • EUR 3950.40
  • 100 ug
  • 10ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 500 ug
  • 50ug
  • 5 mg
Description: Recombinant Human Glutaminase expressed in: E.coli

Recombinant Glutaminase (GLS)

4-RPJ026Mu01
  • EUR 571.58
  • EUR 276.00
  • EUR 1813.44
  • EUR 684.48
  • EUR 1248.96
  • EUR 458.40
  • EUR 4353.60
  • 100 ug
  • 10ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 500 ug
  • 50ug
  • 5 mg
Description: Recombinant Mouse Glutaminase expressed in: E.coli

Recombinant Aspartate Glutamate Carrier Isoform 1, Mitochondrial (Agc1)

4-RPE462Hu01
  • EUR 496.32
  • EUR 256.80
  • EUR 1531.20
  • EUR 590.40
  • EUR 1060.80
  • EUR 408.00
  • EUR 3648.00
  • 100 ug
  • 10ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 500 ug
  • 50ug
  • 5 mg
Description: Recombinant Human Aspartate Glutamate Carrier Isoform 1, Mitochondrial expressed in: E.coli

Recombinant E.Coli Glutaminase 1

7-02857 5µg Ask for price

Recombinant E.Coli Glutaminase 1

7-02858 20µg Ask for price

Recombinant E.Coli Glutaminase 1

7-02859 1mg Ask for price

E.Coli Glutaminase 1 (Recombinant)

20-abx073219
  • EUR 4101.60
  • EUR 393.60
  • EUR 276.00
  • 1 mg
  • 20 ug
  • 5 ug

Glutaminase recombinant monoclonal antibody

A5125 100ul X 3
EUR 714
Description: A recombinant monoclonal antibody from rabbit against human Glutaminase for WB, IHC, IF,ELISA

Recombinant Glutaminase 2 (GLS2)

4-RPJ025Mu01
  • EUR 582.34
  • EUR 279.60
  • EUR 1853.76
  • EUR 697.92
  • EUR 1275.84
  • EUR 465.60
  • EUR 4454.40
  • 100 ug
  • 10ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 500 ug
  • 50ug
  • 5 mg
Description: Recombinant Mouse Glutaminase 2 expressed in: E.coli

Rat Glutaminase (GLS) Protein

20-abx653578
  • EUR 693.60
  • EUR 309.60
  • EUR 2064.00
  • EUR 828.00
  • EUR 510.00
  • 100 ug
  • 10 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 50 ug

Glutaminase Antibody

49063-100ul 100ul
EUR 399.6

Glutaminase Antibody

49063-50ul 50ul
EUR 286.8

Glutaminase Antibody

DF13334 100ul
EUR 420

anti-glutaminase

YF-PA23783 50 ul
EUR 400.8
Description: Mouse polyclonal to glutaminase

Human Kidney mitochondrial carrier protein 1 (SLC25A30)

1-CSB-EP732909HU
  • EUR 456.00
  • EUR 256.80
  • EUR 1570.80
  • EUR 672.00
  • EUR 1047.60
  • EUR 314.40
  • 100ug
  • 10ug
  • 1MG
  • 200ug
  • 500ug
  • 50ug
Description: Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1(SLC25A30) expressed in E.coli

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

20-abx155589
  • EUR 8684.40
  • EUR 4626.00
  • EUR 1074.00
  • 10 × 96 tests
  • 5 × 96 tests
  • 96 tests

Rat Glutaminase (GLS) CLIA Kit

20-abx495597
  • EUR 10282.80
  • EUR 5472.00
  • EUR 1262.40
  • 10 × 96 tests
  • 5 × 96 tests
  • 96 tests

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

abx573176-96tests 96 tests
EUR 801.6

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

DLR-GLS-Ra-48T 48T
EUR 658.8
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Rat Glutaminase (GLS) in samples from serum, plasma, tissue homogenates or other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

DLR-GLS-Ra-96T 96T
EUR 861.6
Description: A sandwich quantitative ELISA assay kit for detection of Rat Glutaminase (GLS) in samples from serum, plasma, tissue homogenates or other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

SEJ026Ra-10x96wellstestplate 10x96-wells test plate
EUR 6149.04
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Rat Glutaminase (GLS) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

SEJ026Ra-1x48wellstestplate 1x48-wells test plate
EUR 611.57
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Rat Glutaminase (GLS) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

SEJ026Ra-1x96wellstestplate 1x96-wells test plate
EUR 822.24
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Rat Glutaminase (GLS) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

SEJ026Ra-5x96wellstestplate 5x96-wells test plate
EUR 3340.08
Description: This is Double-antibody Sandwich Enzyme-linked immunosorbent assay for detection of Rat Glutaminase (GLS) in serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

4-SEJ026Ra
  • EUR 6210.00
  • EUR 3280.80
  • EUR 823.20
  • 10 plates of 96 wells
  • 5 plates of 96 wells
  • 1 plate of 96 wells
Description: Enzyme-linked immunosorbent assay based on the Double-antibody Sandwich method for detection of Rat Glutaminase (GLS) in samples from serum, plasma, tissue homogenates and other biological fluids with no significant corss-reactivity with analogues from other species.

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

RDR-GLS-Ra-48Tests 48 Tests
EUR 699.6

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

RDR-GLS-Ra-96Tests 96 Tests
EUR 973.2

Rat Glutaminase ELISA Kit (GLS)

RK03685 96 Tests
EUR 625.2

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

RD-GLS-Ra-48Tests 48 Tests
EUR 668.4

Rat Glutaminase (GLS) ELISA Kit

RD-GLS-Ra-96Tests 96 Tests
EUR 930

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx007167
  • EUR 493.20
  • EUR 710.40
  • EUR 218.40
  • EUR 376.80
  • 100 ul
  • 200 ul
  • 20 ul
  • 50 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx009560
  • EUR 360.00
  • EUR 526.80
  • EUR 226.80
  • 100 ul
  • 200 ul
  • 30 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx126835
  • EUR 493.20
  • EUR 710.40
  • 100 ul
  • 200 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx111150
  • EUR 878.40
  • EUR 477.60
  • 150 ul
  • 50 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx026703-400ul 400 ul
EUR 627.6

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx026703-80l 80 µl
EUR 343.2

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx026311-400ul 400 ul
EUR 627.6

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx026311-80l 80 µl
EUR 343.2

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx036994-100ug 100 ug
EUR 469.2

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx320185
  • EUR 360.00
  • EUR 292.80
  • 100 ul
  • 50 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx322247
  • EUR 360.00
  • EUR 292.80
  • 100 ul
  • 50 ul

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

abx230717-100ug 100 ug
EUR 610.8

V-Type Proton ATPase Subunit B, Kidney Isoform (ATP6V1B1) Antibody

20-abx326012
  • EUR 376.80
  • EUR 292.80
  • 100 ug
  • 50 ug

Rat Kidney PrimaCell2: Normal Kidney Epithelial Cells

2-82556 1 Kit Ask for price

Custom production of antibodies in 5 Rats using customer supplied antigen (std 63 days protocol)

RAT-5 1
EUR 1365.6

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-100ug

QP7723-ec-100ug 100ug
EUR 489.6

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-10ug

QP7723-ec-10ug 10ug
EUR 240

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-1mg

QP7723-ec-1mg 1mg
EUR 1958.4

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-200ug

QP7723-ec-200ug 200ug
EUR 760.8

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-500ug

QP7723-ec-500ug 500ug
EUR 1272

Recombinant Human Kidney mitochondrial carrier protein 1, His-SUMO, E.coli-50ug

QP7723-ec-50ug 50ug
EUR 315.6

Glutaminase Rabbit mAb

A11043 20 μL
EUR 18

Glutaminase Rabbit mAb

A11043-100ul 100 ul
EUR 492

Glutaminase Rabbit mAb

A11043-200ul 200 ul
EUR 685.2

Glutaminase Rabbit mAb

A11043-20ul 20 ul
EUR 265.2

Glutaminase Rabbit mAb

A11043-50ul 50 ul
EUR 344.4

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx002829
  • EUR 493.20
  • EUR 710.40
  • EUR 218.40
  • EUR 376.80
  • 100 ul
  • 200 ul
  • 20 ul
  • 50 ul

Glutaminase 1 Antibody

20-abx110559
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx112760
  • EUR 878.40
  • EUR 477.60
  • 150 ul
  • 50 ul

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx129148
  • EUR 510.00
  • EUR 159.60
  • EUR 1446.00
  • EUR 693.60
  • EUR 393.60
  • 100 ug
  • 10 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 50 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx129432
  • EUR 526.80
  • EUR 159.60
  • EUR 1479.60
  • EUR 710.40
  • EUR 393.60
  • 100 ug
  • 10 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 50 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

abx034114-400ul 400 ul
EUR 627.6

Glutaminase (GLS) Antibody

abx034114-80l 80 µl
EUR 343.2

Glutaminase Assay Kit

abx298831-100Assays 100 Assays
EUR 661.2

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx303988
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx318516
  • EUR 493.20
  • EUR 2214.00
  • EUR 718.80
  • EUR 218.40
  • EUR 360.00
  • 100 ug
  • 1 mg
  • 200 ug
  • 20 ug
  • 50 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx213860
  • EUR 493.20
  • EUR 360.00
  • 100 ul
  • 50 ul

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx214112
  • EUR 493.20
  • EUR 360.00
  • 100 ul
  • 50 ul

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx172592
  • EUR 1028.40
  • EUR 526.80
  • 1 mg
  • 200 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx172593
  • EUR 1095.60
  • EUR 560.40
  • 1 mg
  • 200 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx176643
  • EUR 1479.60
  • EUR 710.40
  • 1 mg
  • 200 ug

Glutaminase (GLS) Antibody

20-abx176644
  • EUR 1562.40
  • EUR 744.00
  • 1 mg
  • 200 ug

Glutaminase Conjugated Antibody

C49063 100ul
EUR 476.4

Glutaminase-IN-1

HY-114334 100mg
EUR 1230

Anti-glutaminase (5C4)

YF-MA10377 100 ug
EUR 435.6
Description: Mouse monoclonal to glutaminase

Anti-Glutaminase (6H1)

YF-MA13261 100 ug
EUR 435.6
Description: Mouse monoclonal to Glutaminase

Anti-Glutaminase (5C9)

YF-MA13262 200 ul
EUR 435.6
Description: Mouse monoclonal to Glutaminase

Anti-Glutaminase (5B7)

YF-MA13263 100 ug
EUR 435.6
Description: Mouse monoclonal to Glutaminase

Anti-Glutaminase (6E12)

YF-MA13264 100 ug
EUR 435.6
Description: Mouse monoclonal to Glutaminase

Glutaminase Antibody / GLS

RQ4800 100ul
EUR 419

Glutaminase Antibody / GLS

RQ5691 100 ug
EUR 419

Glutaminase Antibody / GLS

RQ6733 100ug
EUR 419
Description: This gene encodes the K-type mitochondrial glutaminase. The encoded protein is an phosphate-activated amidohydrolase that catalyzes the hydrolysis of glutamine to glutamate and ammonia. This protein is primarily expressed in the brain and kidney plays an essential role in generating energy for metabolism, synthesizing the brain neurotransmitter glutamate and maintaining acid-base balance in the kidney. Alternate splicing results in multiple transcript variants.

Glutaminase Antibody / GLS

RQ6734 100ug
EUR 419
Description: This gene encodes the K-type mitochondrial glutaminase. The encoded protein is an phosphate-activated amidohydrolase that catalyzes the hydrolysis of glutamine to glutamate and ammonia. This protein is primarily expressed in the brain and kidney plays an essential role in generating energy for metabolism, synthesizing the brain neurotransmitter glutamate and maintaining acid-base balance in the kidney. Alternate splicing results in multiple transcript variants.

GLSA1 Glutaminase 1 E.Coli Recombinant Protein

PROTP77454 Regular: 20ug
EUR 380.4
Description: GLSA1 E.Coli Recombinant fused with a 20 amino acid His tag at N-terminus produced in E.Coli is a single, non-glycosylated, polypeptide chain containing 330 amino acids (1-310a.a.) and having a molecular mass of 35.0kDa. ;The GLSA1 is purified by proprietary chromatographic techniques.

Porcine ATP synthase subunit alpha liver isoform, mitochondrial,

ELI-48884p 96 Tests
EUR 1113.6

Rat Glutaminase 2 (GLS2) ELISA Kit

abx391386-96tests 96 tests
EUR 1093.2

Применение DHPLC- скрининга гена TGFBR-Three у китаянок с идиопатической преждевременной недостаточностью яичников

 ЦЕЛЬ

Оценить клиническую ценность денатурирующей высокоэффективной жидкостной хроматографии (DHPLC), используемой для выявления полиморфизма 11 и 12 экзонов трансформирующего фактора роста бета-рецептора 3 (TGFBR-3) у женщин с идиопатической преждевременной недостаточностью яичников (POF) .

МЕТОДЫ

С февраля 2009 года по декабрь 2011 года 110 пациентов с идиопатической ПНЯ, проходивших лечение в Шэньчжэньском институте здоровья матери и ребенка при Южном медицинском университете, были включены в это исследование в качестве группы ПНЯ . Между тем, контрольную группу составили 110 женщин до 40 лет с нормальным гормональным уровнем и менструальным циклом. В экзоны 11 и 12 TGFBR-3 полиморфизма гена подвергали скринингу с помощью DHPLC, и результаты секвенирования ДНК был золотым стандартом. Были рассчитаны некоторые связанные индексы, такие как чувствительность, специфичность, ложноотрицательное значение, ложноположительное значение, индекс Юдена, положительный прогноз.значение и отрицательное прогностическое значение. В то же время 20% протестированных образцов были выбраны случайным образом и снова обнаружены методом DHPLC. Значение индекса Каппа рассчитывали путем сравнения результатов первого и второго анализа DHPLC.

ПОЛУЧЕННЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ

В экзоне 11 TGFBR-Three не было идентифицировано полиморфизм гена, и в экзоне 12 были идентифицированы два нуклеотидных полиморфизма. Для полиморфизма 2022 T / C частоты CC с 0,9% (1/110), TC с 22,7% (25/110). ), TT с 76,4% (84/110), C с 12,3% (27/220) и T с 87,7% (193/220) в группе POF значительно отличались от CC с 0, TC с 9,1% (10/110 ) и TT с 90,9% (100/110), C с 4,5% (10/220) и T с 95,5% (210/220) в контрольной группе (все P <0,05).

Частоты аллелей и генотипов 2161-75 C / T существенно не различались между двумя группами (все P> 0,05). В качестве золотого стандарта секвенирование ДНК показало, что DHPLC показал, что чувствительность составила 100%, специфичность — 97,9%, индекс Юдена — 97,9%, прогностическая ценность положительного результата — 96,3%, прогностическая ценность отрицательного результата — 100%, а индекс Каппа — 0,888 (P <0,05). ).

ВЫВОДЫ

Анализ DHPLC — это более надежный, надежный и практичный метод выявления полиморфизма TGFBR-3 при идиопатической преждевременной недостаточности яичников.

Фрагмент последовательности ДНК, содержащий мутацию от C до A, как удобный стандарт мутации для   анализа DHPLC .

 ЦЕЛЬ

Денатурирующая высокоэффективная жидкостная хроматография (DHPLC) — это высокопроизводительный подход для скрининга вариаций последовательности ДНК. Для оценки калибровки печи, производительности картриджа, состава и стабильности буфера используются стандарты мутации низкого и высокого диапазона WAVE для обеспечения воспроизводимости и точности хроматографического анализа. Целью этого исследования было предоставить экономичный самодельный стандарт мутаций для анализа DHPLC .

МЕТОДЫ

DHPLC выполняли для оценки различных температур элюирования фрагмента ДНК размером 374 п.н. с мутацией C> A в положении 59 для достижения профиля пика, аналогичного стандарту с низким уровнем мутаций. Чтобы проверить воспроизводимость домашнего стандарта мутации с использованием DHPLC , было проведено 15 различных экспериментов для сравнения домашнего стандарта мутации, стандарт мутации низкого диапазона WAVE с положительным контрольным образцом ДНК.

ПОЛУЧЕННЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ

Мы определили сравнимую температуру элюирования и профиль пика со стандартом WAVE Low Vary Mutation Customary.

ВЫВОДЫ

Это исследование подтвердило воспроизводимость профиля пика нашего домашнего стандарта мутаций по сравнению со стандартом с низким уровнем мутаций с использованием анализа DHPLC .

Синдром Аладжиля: новая недостоверная мутация, обнаруженная с помощью секвенирования всего экзома в случае, ранее признанном отрицательным с помощью  DHPLC  и MLPA .

 Синдром Алажиля (ALGS, MIM 118450) — аутосомно-доминантное мультисистемное заболевание с высокой вариабельностью. Описаны два гена: JAG1 и NOTCH2. Распространенность среди населения составляет 1:70 000 в зависимости от наличия у новорожденных заболеваний печени. Большинство случаев ( ~ 97 %) вызвано гаплонедостаточностью гена JAG1 на 20p11.2p12 , либо из-за мутаций или делеций в локусе. Менее 1% случаев вызваны мутациями в NOTCH2 .

Наиболее широко используемые методы мутационного скрининга включают денатурирующую высокоэффективную жидкостную хроматографию (DHPLC) и мультиплексную амплификацию зонда, зависимую от лигирования (MLPA) . Совсем недавно секвенирование всего экзома (WES) стало технически возможным благодаря недавним достижениям в технологиях секвенирования следующего поколения, что открывает новые возможности для идентификации мутаций / генов. Пробанд и его семейство, отрицательные на наличие мутаций в генах JAG1 и NOTCH2 ни DHPLC, ни MLPA, были проанализированы с помощью WES . Была идентифицирована миссенс-мутация, ранее не описанная, в гене JAG1. Этот результат показывает улучшение частоты обнаружения мутаций благодаря новой технологии секвенирования, что указывает на острую необходимость повторного анализа всех отрицательных случаев.

 

Have any Question or Comment?

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *